Сделайте портабельную версию!

Какой в этом смысл? Запускать каждый раз пере установкой?

смысл не засирать диск С и реестр не особо важными программами.
программу можно разместить не на диске С и добавить в автозагрузку (отложенную автозагрузку)
допустим после необходимой переустановки системы портабельную программу не нужно заново устанавливать
почти все программы использую в портабельном виде.
Прежде чем ставить минус разумно прочитать ответ на заданный вопрос... Если тебе не нужно это не значит, что кому то это тоже не нужно.

Там настроек одна галочка.

Вся вкусность программы именно в том, что она ставит себя как служба и автоматически по тихому обновляется. Допустим - ну зделали для тебя портабл, ну скачал ты свежий дистр какой-нибудь прожки с напиханным внутрь хламом. Запускаешь ты свою портаблу - а она опа - и не знает типа этого дистра и галочки не убрались. И получишь ты в свежеустановленную систему полный букет хлама.